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drug discovery

13 items

RESEARCHarXiv CS.LG·hace 11d

Molecular Lead Optimization via Agentic Tool Planning

Este artículo presenta TRACE, un agente de razonamiento LLM consciente de la trayectoria para la optimización molecular de leads, abordando la limitación de la optimización molecular en un solo paso. Formula la selección de herramientas como un problema de toma de decisiones secuenciales sobre trayectorias de acción, esencial para transformar los compuestos iniciales en candidatos a fármacos viables. TRACE busca mejorar las propiedades relacionadas con ADMET mediante un refinamiento estructural sutil, preservando las subestructuras moleculares clave.

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RESEARCHarXiv CS.LG·13/4/2026

MolPaQ: Modular Quantum-Classical Patch Learning for Interpretable Molecular Generation

MOLPAQ es un novedoso generador modular cuántico-clásico que crea moléculas interpretables a partir de parches latentes generados cuánticamente, logrando un 100% de validez RDKit y alta novedad y diversidad. Este enfoque mejora significativamente el control de propiedades como QED y la incidencia de motivos aromáticos en comparación con los generadores clásicos.

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RESEARCHarXiv CS.LG·hace 25d

Rethinking Molecular OOD Generalization via Target-Aware Source Selection

Esta investigación aborda desafíos en la predicción robusta de propiedades moleculares bajo escenarios extremos fuera de distribución (OOD), cruciales para el descubrimiento de fármacos impulsado por IA. Propone SCOPE-BENCH, un nuevo benchmark para la evaluación del rendimiento OOD, y POMA, un framework para la adaptación de múltiples fuentes para superar las limitaciones de los métodos existentes.

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RESEARCHarXiv CS.LG·hace 14d

A Large-Scale Dataset and Benchmark: Do Protein-Ligand Models Learn Binding Sites or Just Binding Likelihood?

El documento introduce InteractBind, un conjunto de datos a gran escala de aproximadamente 100 mil pares proteína-ligando, junto con un benchmark para una evaluación detallada. Su objetivo es determinar si los modelos pueden localizar sitios de unión e identificar interacciones no covalentes, abordando una deficiencia en las evaluaciones existentes.

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RESEARCHarXiv CS.LG·6/4/2026

DrugPlayGround: Benchmarking Large Language Models and Embeddings for Drug Discovery

Este conteúdo apresenta o DrugPlayGround, um framework para avaliar e comparar o desempenho de Large Language Models (LLMs) na descoberta de medicamentos. Ele foca na geração de descrições textuais de características de medicamentos, sinergismo, interações proteína-medicamento e respostas fisiológicas, com a participação de especialistas para justificar as previsões dos LLMs.

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