protein language models

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RESEARCHarXiv CS.LG·11/5/2026

Conditional generation of antibody sequences with classifier-guided germline-absorbing discrete diffusion

Esta investigación presenta un enfoque novedoso para la generación condicional de secuencias de anticuerpos, abordando las limitaciones de los modelos de lenguaje de proteínas actuales al modelar mejor la variación somática y permitir la generación condicional guiada por clasificadores. Propone el ajuste fino por difusión discreta y la difusión absorbente de la línea germinal para mejorar el diseño de anticuerpos.

Antibody Design Diffusion Models computational biology protein language models

RESEARCHarXiv CS.LG·hace 28d

Structural Interpretations of Protein Language Model Representations via Differentiable Graph Partitioning

Esta investigación propone un marco para interpretar representaciones de modelos de lenguaje de proteínas, proyectándolas en grafos de contacto proteicos y aplicando SoftBlobGIN, una Red de Isomorfismo de Grafos. Este método realiza un paso de mensajes consciente de la estructura para aprender subestructuras funcionales, logrando un 92,8% de precisión en la clasificación de enzimas y proporcionando explicaciones estructurales auditables.

AI interpretation protein language models structural biology Graph Neural Networks