protein language models

2 items

RESEARCHarXiv CS.LG·vor 29T

Conditional generation of antibody sequences with classifier-guided germline-absorbing discrete diffusion

Diese Forschung stellt einen neuen Ansatz zur bedingten Generierung von Antikörpersequenzen vor, der die Einschränkungen bestehender Protein-Sprachmodelle durch eine bessere Modellierung somatischer Variationen und die Ermöglichung flexibler klassifikatorgeführter Generierung überwindet. Sie schlägt diskrete Diffusions-Feinabstimmung und Keimbahn-absorbierende Diffusion zur Verbesserung des Antikörperdesigns vor.

Antibody Design Diffusion Models computational biology protein language models

RESEARCHarXiv CS.LG·vor 27T

Structural Interpretations of Protein Language Model Representations via Differentiable Graph Partitioning

Diese Forschung schlägt einen Rahmen vor, um Repräsentationen von Protein-Sprachmodellen zu interpretieren, indem sie auf Proteinkontaktgraphen projiziert und SoftBlobGIN, ein Graphen-Isomorphismus-Netzwerk, angewendet wird. Diese Methode führt eine strukturbewusste Nachrichtenübertragung durch, um funktionale Unterstrukturen zu lernen, erreicht eine Genauigkeit von 92,8% bei der Enzymklassifizierung und liefert nachvollziehbare strukturelle Erklärungen.

AI interpretation protein language models structural biology Graph Neural Networks