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drug discovery

13 items

RESEARCHarXiv CS.LG·11d atrás

Molecular Lead Optimization via Agentic Tool Planning

Este artigo propõe o TRACE, um agente de raciocínio LLM com consciência de trajetória para otimização de leads moleculares, abordando a limitação de otimização molecular de uma etapa. Ele formula a seleção de ferramentas como um problema de tomada de decisão sequencial em trajetórias de ação, crucial para transformar compostos iniciais em candidatos a medicamentos viáveis. O TRACE melhora as propriedades relacionadas ao ADMET por meio de refinamento estrutural sutil, preservando as subestruturas moleculares chave.

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RESEARCHarXiv CS.LG·13/04/2026

MolPaQ: Modular Quantum-Classical Patch Learning for Interpretable Molecular Generation

MOLPAQ é um novo gerador modular quântico-clássico que cria moléculas interpretáveis a partir de patches latentes gerados quanticamente, alcançando 100% de validade RDKit e alta novidade e diversidade. Esta abordagem melhora significativamente o controle de propriedades como QED e a incidência de motivos aromáticos em comparação com geradores clássicos.

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RESEARCHarXiv CS.LG·25d atrás

Rethinking Molecular OOD Generalization via Target-Aware Source Selection

Esta pesquisa aborda desafios na predição robusta de propriedades moleculares em cenários extremos de out-of-distribution (OOD), cruciais para a descoberta de medicamentos impulsionada por IA. Ela propõe SCOPE-BENCH, um novo benchmark para avaliação de desempenho OOD, e POMA, um framework para adaptação multi-fonte para superar as limitações dos métodos existentes.

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RESEARCHarXiv CS.LG·14d atrás

A Large-Scale Dataset and Benchmark: Do Protein-Ligand Models Learn Binding Sites or Just Binding Likelihood?

O artigo apresenta InteractBind, um extenso conjunto de dados com cerca de 100 mil pares proteína-ligante, e um benchmark para avaliação detalhada. Ele visa verificar se os modelos podem localizar sítios de ligação e identificar interações não covalentes, preenchendo uma lacuna nas avaliações existentes.

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RESEARCHarXiv CS.LG·06/04/2026

DrugPlayGround: Benchmarking Large Language Models and Embeddings for Drug Discovery

Este conteúdo apresenta o DrugPlayGround, um framework para avaliar e comparar o desempenho de Large Language Models (LLMs) na descoberta de medicamentos. Ele foca na geração de descrições textuais de características de medicamentos, sinergismo, interações proteína-medicamento e respostas fisiológicas, com a participação de especialistas para justificar as previsões dos LLMs.

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